Cyanine5 是 qPCR 中使用的染料之一。许多 qPCR 机器上都有相应的过滤器组。这种反应衍生物可用于合成在 5' 端（荧光团最典型的位置）具有 Cyanine5 的 qPCR 探针。这是一种非核苷终止试剂。